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1.
Rev. argent. microbiol ; 54(3): 11-20, set. 2022. graf
Artigo em Espanhol | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1407191

RESUMO

Resumen Trichophyton benhamiae es un dermatofito zoofílico. Puede causar tinea corporis, tinea faciei y tinea capitis. Se caracteriza por producir lesiones inflamatorias, sobre todo en niños. El objetivo de esta publicación es describir 7 casos clínicos de pacientes pediátricos atendidos entre julio del 2019 y enero del 2020 en nuestra institución. A los pacientes se les solicitó estudio micológico convencional, con posterior confirmación con MALDI-TOF MS y secuencia-ción del ADN ribosomal. Se aisló e identificó T. benhamiae como agente etiológico; el nexo epidemiológico fue el contacto con cobayos. Estas son las primeras descripciones de infecciones causadas por T. benhamiae en Argentina. Al realizar estudios micológicos convencionales, este agente puede confundirse con otros dermatofitos, por lo tanto, se requieren herramientas como MALDI-TOF MS o la secuenciación para llegar a un diagnóstico definitivo. Es importante contar con datos epidemiológicos, como el contacto con mascotas no tradicionales, para una presunción diagnóstica adecuada.


Trichophyton benhamiae is a zoonotic dermatophyte that can cause tinea corporis, tinea faciei and tinea capitis, producing inflammatory lesions, especially in children. In this publication, we describe 7clinical cases of pediatric patients that occurred in our institution between July 2019 and January 2020. All patients underwent a conventional mycological study. The identification of fungi isolates was confirmed by MALDI-TOF MS and sequencing of the ribosomal DNA. T. benhamiae was identified as the etiological agent, whose epidemiological link in all cases was the contact with Guinea pigs. This is the first description of infections caused by T. benhamiae in Argentina. This dermatophyte can be misidentified as other more frequent dermatophytes when performing conventional studies. Molecular technology should be used to reach a definitive diagnosis. It is important to have epidemiological data from patients such as contact with non-traditional pets, especially Guinea pigs, for an adequate presumptive diagnosis of this dermatophytosis.

2.
Rev. argent. microbiol ; 54(3): 71-80, set. 2022. graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1407197

RESUMO

Abstract We report a case of disseminated histoplasmosis and COVID-19 infection in a renal transplant recipient in Argentina. The patient exhibited respiratory symptoms, and a chest computed tomography scan (CT) showed multiple bilateral centrilobular opacities with a tree-in-bud pattern in both lobes. The patient was initially treated as having bacterial community-acquired pneumonia, and then tuberculosis. A month later, histoplasmosis was diagnosed, and Histoplasma capsulatum LAmB clade was isolated from sputum, skin and oral lesions. The patient was hospitalized and treatment was started with intravenous liposomal amphotericin B. During the course of the antifungal therapy the respiratory symptoms worsened, a new chest CT showed a unilateral lesion with a ground glass appearance and SARS-CoV-2 was detected in a new nasopharyngeal sample. In addition, plasma therapy was administered, and the immunosuppressive regimen was adjusted (everolimus was interrupted, mycophenolate mofetil reduced, and meprednisone increased). Finally, the patient's progress was favorable and was discharged after five days on oral itraconazole treatment for histoplasmosis.


Resumen Se presenta un caso de histoplasmosis diseminada e infección por COVID-19 en un paciente trasplantado renal en Argentina. El paciente presentó un cuadro clínico respiratorio, y la tomografía computarizada (TC) de tórax mostró múltiples opacidades centrolobulillares bilaterales con patrón de árbol en brote. El paciente fue tratado inicialmente con antibióticos para agentes causantes de neumonía bacteriana adquirida en la comunidad y luego como tuberculosis. Un mes después se le diagnosticó una histoplasmosis diseminada y el hongo fue aislado del esputo, la piel y la mucosa oral. El hongo fue tipificado molecularmente como Histoplasma capsulatum clado LAmB. El paciente fue hospitalizado y se inició tratamiento con anfoteric-ina B liposomal vía intravenosa. Durante el transcurso de la terapia antifúngica los síntomas respiratorios del paciente empeoraron, una nueva TC de tórax mostró una lesión unilateral con apariencia de vidrio esmerilado y se detectó SARS-CoV-2 en el hisopado nasofaríngeo. El paciente fue tratado con plasmoterapia y se modificó el régimen de inmunosupresión (se interrumpió everolimus, se redujo micofenolato de mofetilo y se incrementó la meprednisona). La evolución del paciente fue favorable y fue dado de alta con tratamiento oral con itraconazol.

3.
Rev. argent. microbiol ; 54(1): 1-10, mar. 2022. graf
Artigo em Espanhol | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1407161

RESUMO

Resumen Evaluamos las concordancias interlaboratorio, esencial y categórica entre el panel Sensititre YeastOne™ y los métodos de referencia correspondientes al M27 4.a ed. (Clinical and Laboratory Standards Institute [CLSI]) y al EDef 7.3.1 (European Committee on Antifungal Susceptibility Testing [EUCAST]). Estudiamos 67 cepas de Candida de distintas muestras clí nicas y un panel de 9 cepas resistentes a fluconazol y equinocandinas. El mayor porcentaje de concordancia interlaboratorio se observó con anfotericina B (96,8%) y el menor porcen taje con voriconazol (77,2%). La caspofungina mostró un 5,8% de discrepancias muy mayores con el método de referencia del CLSI. Con el del EUCAST, el itraconazol, el posaconazol y la anidulafungina mostraron porcentajes de discrepancias mayores: el 17,6, el 18,1 y el 19,6%, respectivamente. El panel Sensititre YeastOne™ es una alternativa confiable y fácil de usar, que permite detectar especies de Candida resistentes a los antifúngicos, con algunas limitaciones para las equinocandinas. Los resultados son equiparables a los de los métodos de referencia.


Abstract We evaluated the interlaboratory agreement, the essential agreement, and the cate- gorical agreement between the Sensititre YeastOne™ panel and the reference methods M27 4th Edition of the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), and the EDef 7.3.1 of the Euro- pean Committee on Antifungal Susceptibility Testing (EUCAST). We studied 67 Candida strains isolated from different clinical samples and 9 Candida strains with resistance to fluconazole and echinocandins. The highest percentage of interlaboratory agreement was observed with amp- hotericin B (96.8%), and the lowest percentage with voriconazole (77.2%). Caspofungin showed 5.8% of very major errors when compared with the CLSI reference method. For EUCAST, itraconazole, posaconazole, and anidulafungin showed high percentages of major errors: 17.6%, 18.1%, and 19.6%, respectively. Sensititre YeastOne™ is a reliable alternative, and easy to perform for detecting Candida species resistant to antifungal drugs, with some limitations for echinocandins. Results are comparable to those of the reference methods.

4.
Infectio ; 23(1): 55-57, Jan.-Mar. 2019. graf
Artigo em Espanhol | LILACS, COLNAL | ID: biblio-975564

RESUMO

Las micosis rino-cerebral, rino-orbito-cerebral y sinusopulmonar ocasionadas por especies de Mucorales y de Aspergillus se constituyen como una causa importan te de infección fúngica invasora asociada a una mortalidad mayor al 30%. La coinfección por dos o más especies en la forma rino-orbito-cerebral es infrecuente. Se describe un paciente con linfoma no Hodgkin, expuesto a múltiples esquemas quimioterápicos, en remisión completa, que presentó micosis con compromiso rino-orbito-cerebral por Aspergillus sclerotiorum y Rhizopus microsporum de rápida progresión con necesidad de tratamiento quirúrgico agresivo y terapia anti fúngica sistémica y local.


Rhino-orbital-cerebral and pulmonary mycosis caused by Mucorales and Aspergillus species have become an important cause of invasive fungal infection, with a 30% overall mortality rate. Rhino-orbital-cerebral disease caused by two or more species is uncommon. We present a patient with non-Hodgkin lymphoma, ex posed to aggressive chemotherapy, under complete remission, with acute onset of rhino-orbital-cerebral disease caused by Aspergillus sclerotiorum and Rhizopus microsporum, treated with aggressive surgery and both local and systemic antifungal therapy.


Assuntos
Humanos , Masculino , Idoso , Aspergillus , Rhizopus/virologia , Sinais e Sintomas Respiratórios , Mucorales , Micoses , Linfoma não Hodgkin , Causalidade , Coinfecção , Infecções Fúngicas Invasivas , Microsporum
5.
Rev. argent. microbiol ; 49(1): 7-14, mar. 2017. ilus, tab
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1041775

RESUMO

Se evaluaron 3 metodologías de extracción de proteínas para la identificación de hongos miceliales por MALDI-TOF MS en 44 aislados: la extracción con agua-ácido fórmico (E. agua), la extracción con zirconio-etanol-acetonitrilo-ácido fórmico (E. zirconio) y la recomendada por el proveedor del equipo (E. tubo). Se compararon 2 bases de datos: Bruker (BK) y BK + National Institutes of Health. Los resultados obtenidos utilizando dichas bases fueron los siguientes (en el orden citado): identificación correcta (IC) a nivel de género, 10 y 16 con E. agua; 27 y 32 con E. zirconio y 18 y 23 con E. tubo; IC a nivel de especie, 5 y 7 con E. agua; 17 y 20 con E. zirconio y 11 y 14 con E. tubo; identificaciones no confiables, 18 y 12 con E. agua y 9 y 4, tanto con E. zirconio como con E. tubo; ausencia de pico, 16 con E. agua, 8 con E. zirconio y 17 con E. tubo. La extracción con zirconio mostró el mejor rendimiento (p < 0,05).


In order to optimize the identification of molds with MALDI-TOF MS, three protein extraction-methodologies were evaluated against 44 isolates: water extraction (WE), zirconium extraction (ZE) and the provider's recommended method (PRM). Two data bases were compared, Bruker (BK) and Bruker + National Institutes of Health. Considering both databases, results were respectively as follows: correct identification (CI) at gender level, 10 and 16 by WE; 27 and 32 by ZE and 18 and 23 by PRM; CI at species level, 5 and 7 by WE; 17 and 20 by ZE and 11 and 14 by PRM; non-reliable identification, 18 and 12 by WE; 9 and 4 by ZE and by PRM. No peaks were observed in 16 by WE, 8 by ZE and 17 by PRM. ZE showed the best perfomance (p < 0.05).


Assuntos
Proteínas/análise , Micélio/classificação , Fungos/classificação , Espectrometria de Massas/métodos , Bases de Dados Factuais/estatística & dados numéricos
6.
Dermatol. argent ; 22(1)2016. ilus
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-859131

RESUMO

La verrugosis generalizada es un rasgo común a diferentes síndromes de inmunodeficiencia, cuyo prototipo es la epidermodisplasia verruciforme (EV). Se presenta una paciente con síndrome WILD (Warts, Immunodeficiency, Lymphoedema, anogenital Dysplasia), que consultó por verrugas profusas, con displasia genital y linfedema. La presencia de DNA para los papilomavirus de los grupos I y II se reveló con hibridización molecular por captura híbrida en microplaca para detección del DNA de HPV de lesiones de cuello uterino. La inmunofenotipificación en sangre periférica demostró población linfoide con moderado aumento de poblaciones NK y TNK, sin evidencia inmunofenotípica de población B clonal. Las verrugas planas mejoraron con retinoides sistémicos e imiquimod tópico. La displasia genital desapareció luego de la vacunación para HPV con vacuna cuadrivalente (AU)


Generalized verrucosis is a common characteristic of several immunodeficiency disorders whose prototype is the epidermodysplasia verruciformis. We report a patient with WILD SYNDROME (Warts, Immunodeficiency, Lymphoedema and anogenital Dysplasia) who consulted for profuse warts, genital dysplasia and limphoedema. The presence of DNA from papillomavirus groups I and II was revealed by molecular hybridization with hybrid capture in microplate for HPV DNA detection of uterine cervical lesions. Immunophenotyping in peripheral blood showed lymphoid population with moderate increase in NK and TNK populations without immunophenotypic evidence of clonal B population. Flat warts improved with systemic retinoids and topical imiquimod. The genital dysplasia disappeared after vaccination with quadrivalent HPV vaccine (AU)


Assuntos
Humanos , Masculino , Adulto , Piedra/diagnóstico , Trichosporon , Axila/microbiologia , Infecções
7.
Rev. argent. microbiol ; 46(2): 111-118, jun. 2014. tab, mapas
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: lil-734573

RESUMO

El objetivo de este trabajo fue evaluar los resultados de sensibilidad a los antifúngicos de diversas especies de Candida utilizando el sistema semiautomatizado Vitek 2 (tarjetas AST-YSO1; bioMérieux), y compararlos con los obtenidos por el método de referencia del Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), la microdilución en caldo (Documento M27-A3, 2008). La concordancia esencial fue > 90 %, excepto en el caso de Candida glabrata frente al voriconazol (VCZ) y de Candida krusei frente al fluconazol (FCZ). La concordancia global por categoría (variación no mayor que 2 diluciones, sin discriminar por especie) fue > 90 % cuando se evaluó el FCZ, y 89,5 % a las 24 h y 80,7 % a las 48 h con el VCZ. El tiempo promedio para obtener los resultados fue de 15,5 h. Los errores menores (sensible o resistente por un método y dosis dependiente por el otro) para FCZ fueron de 7,8 % a las 24 h y 6,1 % a las 48 h; para VCZ, 10,5 % a las 24 h y 19,3 % a las 48 h. Solo se detectó 1 error muy mayor (resistente por el método de referencia y sensible por Vitek 2) con Candida parapsilosis frente a FCZ a las 48 h. No se observaron errores mayores (sensibles por el método de referencia y resistentes por Vitek 2). Con respecto a la anfotericina B, solo 3 cepas presentaron una CIM = 2 ?g/ml. El sistema Vitek 2 detectó correctamente el valor de CIM para diversas especies de Candida y presentó una excelente concordancia con el método de referencia propuesto por el CLSI.


The aim of this investigation was to evaluate the results of antifungal susceptibility for various Candida species using the Vitek 2 semi-automated system (AST-YSO1 cards, bioMérieux), and to compare them with those obtained by the CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) broth microdilution reference method (Document M27-A3,2008). The essential agreement (EA) was > 90%, except for Candida glabrata against voriconazole (VCZ); and for Candida krusei against fluconazole (FCZ). The overall categorical agreement (CA) was > 90% when FCZ was evaluated and 89.5% at 24 h and 80.7% at 48 h for VCZ. The average time for obtaining results was 15.5 h. Minor errors were 7.8% at 24 h and 6.1% at 48 h for FCZ, and 10.5% at 24 h and 19.3% at 48 h for VCZ. There was only one very major error for FCZ against Candida parapsilosis and no major errors were observed. For amphotericin B, only three isolates showed MICs = 2 ?g/ml. The Vitek 2 system detected the MIC value for various Candida species and showed excellent agreement with the reference method proposed by the CLSI.


Assuntos
Humanos , Anfotericina B/farmacologia , Antifúngicos/farmacologia , Candida/efeitos dos fármacos , Fluconazol/farmacologia , Pirimidinas/farmacologia , Triazóis/farmacologia , Testes de Sensibilidade Microbiana , Micologia/métodos , Voriconazol
8.
Rev. argent. microbiol ; 46(2): 107-110, jun. 2014.
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1015634

RESUMO

El objetivo del trabajo fue evaluar el desempeño de las tarjetas YST del sistema Vitek 2 para la identificación de levaduras del género Candida. Se analizaron 168 aislamientos; los resultados fueron comparados con los obtenidos por los equipos API 20C AUX (24 %) o API ID 32C (76 %). Cada cepa se subcultivó en agar cromogénico para levaduras y se observó la micromorfología. C. albicans y C. dubliniensis fueron identificadas a través de pruebas bioquímicas y moleculares adicionales. La concordancia observada fue del 98,3 %. Solo tres cepas no fueron identificadas correctamente por el sistema Vitek 2: una cepa de C. tropicalis y una de C. krusei fueron identificadas erróneamente como C. parapsilosis y otra cepa de C. krusei fue identificada de manera incompleta por el software del equipo. El tiempo promedio de identificación con las tarjetas YST fue de 18,25 h. El sistema Vitek 2 surge como un método confiable, simple y efectivo para la identificación de las principales especies del género Candida


The aim of this investigation was to evaluate the performance of Vitek 2 YST cards (bioMérieux, Inc., Hazelwood, MO, USA) for the identification of yeasts of the genus Candida. A total of 168 isolates were analyzed and the results were compared to those of the API 20C AUX (24%) o API ID 32C (76%) kits (bioMérieux, Marcy L'Etoile, France). Each isolate was grown in chromogenic agar and in corn meal agar (Oxoid, UK) to observe its micromorphology. C. albicans and C. dublininesis were identified by additional biochemical and molecular tests. The agreement observed was 98.3%. Only three isolates were incorrectly identified by Vitek 2: one strain of C .tropicalis and one strain of C. krusei were identified as C. parapsilosis by YST while one strain of C. krusei was identified with low discrimination. The average time for obtaining results was 18.25 h. Vitek 2 is a simple, safe and useful system for the identification of significant Candida species


Assuntos
Candida/classificação , Técnicas de Tipagem Micológica/métodos , Candida/isolamento & purificação , Estudos de Avaliação como Assunto
9.
Rev. argent. microbiol ; 43(2): 120-126, jun. 2011. tab
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: lil-634683

RESUMO

Los métodos de referencia E. Def 7.1 y M27-A3, que detectan resistencia in vitro a los antifúngicos, son onerosos y muy laboriosos, por lo que su implementación en los laboratorios hospitalarios es limitada. Existen técnicas comerciales de simple realización, que permitirían obtener resultados comparables a los que se obtienen con los métodos estándares. Los objetivos de esta investigación fueron: a) comparar los resultados de concentración inhibitoria mínima obtenidos según el método de referencia E.Def 7.1 con los obtenidos mediante el empleo del equipo comercial ATB® Fungus 3 en un conjunto de 82 aislamientos clínicos de Candida spp. frente a los siguientes antifúngicos: anfotericina B, 5-fluorocitosina, fluconazol e itraconazol; b) comparar en ese mismo conjunto de aislamientos los resultados del estudio de sensibilidad al fluconazol por difusión en agar empleando tabletas Neo-SensitabsTM o discos Malbrán con los que se obtienen por el método de referencia. La concordancia general entre el método de referencia y el ATB® Fungus 3 fue del 90,2 %, mientras que la concordancia del método de referencia con los métodos por difusión con discos y con tabletas alcanzó el 96,3% y el 92,7 %, respectivamente. El ATB® Fungus 3 fue eficaz para determinar la sensibilidad a la anfotericina B y a la 5-fluorocitosina, pero se observaron discrepancias al evaluar la sensibilidad a los azoles. Los métodos por difusión resultaron útiles para determinar la sensibilidad al fluconazol; sin embargo, observamos 3 discrepancias muy mayores, 1 mayor y 2 menores con el método de difusión con tabletas, mientras que con los discos solo se produjeron 3 discrepancias menores.


Reference methods E.Def 7.1 and M27-A3 detect in vitro resistance; however, they are expensive and very laborious. Thus, their actual use in hospital laboratories is limited. There are commercial techniques available, having easier accessibility and development, which would yield results comparable to those of the reference methods. The objectives of this study were: a) to compare the results of minimal inhibitory concentration of 82 Candida spp. clinic isolates according to reference method E.Def 7.1 and ATB® Fungus 3; b) to compare the results of fluconazole susceptibility testing by disk diffusion in agar with Neo-SensitabsTM tablets and Malbrán disks with those of the reference methods. Minimal inhibitory concentration for amphotericin B, 5-flucytosine, fluconazole and itraconazole was performed according to the E.Def 7.1 and the ATB Fungus 3 methods and diffusion was carried out with fluconazole disks and tablets. General concordance between the reference method and ATB Fungus 3 was 90.2 % and 96.3 and 92.7% for diffusion with disks and tablets. The ATB Fungus 3 method was effective to determine susceptibility against amphotericin B and 5-flucytosine; however, discrepancies were observed with azole drugs. Disk diffusion methods are useful to determine susceptibility to fluconazole; however, 3 very major, 1 major and 2 minor errors were observed with the tablets, whereas only 3 minor errors were observed with the disks.


Assuntos
Feminino , Humanos , Masculino , Antifúngicos/farmacologia , Candida/efeitos dos fármacos , Farmacorresistência Fúngica , Testes de Sensibilidade Microbiana/métodos , Argentina , Anfotericina B/farmacologia , Candidíase/microbiologia , Testes de Sensibilidade a Antimicrobianos por Disco-Difusão , Farmacorresistência Fúngica Múltipla , Fluconazol/farmacologia , Flucitosina/farmacologia , Itraconazol/farmacologia , Reprodutibilidade dos Testes , Especificidade da Espécie , Comprimidos
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